保護地球和平的奧特曼曾經是神一樣的存在，但是近幾十年，他卻行蹤成謎，隨之取代他的是隸屬於GSB全球安全保衛局的鋼鐵飛龍精銳分隊。GSB近期不斷收到地球能源異常報告，全球出現巨大災難先兆。鋼鐵飛龍被派來徹查此事，卻意外發現事件與消失半個世紀的奧特曼有關係…